پژوهشگاه دانش‌های بنیادی با همکاری انجمن فیزیک ایران از سال ۱۳۹۰ به رساله‌های برتر دکتری فیزیک که در داخل کشور تهیه شده باشند جایزه‌ای به نام «جایزۀ علیمحمدی» اعطا می‌کند. این جایزه به پاس خدمات علمی و دانشگاهی شهید دکتر مسعود علیمحمدی استاد فقید دانشگاه تهران و اولین دانش‌آموختۀ دکتری فیزیکِ داخل کشور، از جمله نقش مؤثرش در زیرساخت علمی پژوهشگاه دانش‌های بنیادی و تلاش‌های وی برای برپایی تحصیلات تکمیلی در ایران، به نام او نامگذاری شده است.

این جایزه در سال ۱۳۹۹ به رساله‌های دکتری برگزیده در رشته فیزیک که در داخل کشور تهیه شده و طی سال های ۱۳۹۶ الی ۱۳۹۸ مرحلۀ دفاع را گذرانده باشند، اعطا می‌شود.
برای ورود به مرحلۀ داوری، لازم است کارهای پژوهشی انجام‌شده در دورۀ دکتری و رسالۀ حاصل از آن، به تشخیصِ حداقل سه عضو هیئت علمیِ استادیار به بالا، که استاد راهنمای رسالۀ دکتری نیز یکی از آنان است، به عنوان «رسالۀ ممتاز» شناخته شده باشد. نامزدی هر شرکت‌کننده باید کتباً توسط استاد راهنما با ذکر اطلاعات مربوط به متقاضی، دلایل، مستندات، و مقالات مستخرج از رساله اعلام شود. توصیه نامه حداقل ۲ استاد تأیید کننده دیگر می‌بایست پس از ثبت نام متقاضی توسط اساتید به آدرس پست الکترونیکی amprize@ipm.ir ارسال شود. ثبت نام متقاضی و بارگذاری مدارک و مستندات لازم است تا تاریخ ۳۰ بهمن‌ماه ۱۳۹۸ در پایگاه اینترنتی به آدرس زیر انجام شود.